
iSeq Sequencing
2022. 8. 22. 00:15
NGS
Yeild iSeq 시퀀싱 결과, 1.9 Gbp(1.9 x 10^9 bp)가 얻어진다. Yeild는 최소 1.5 Gbp로, 이보다 더 적은 yeild 값이 나오면 문제가 있는 것이다. Read 시퀀싱 기기로 한 번에 읽는 단위를 read라 한다. 한 번에 읽는 read의 길이를 read length라 한다. iSeq으로 run을 돌리면 한 번에 150 bp씩 읽고, 따라서 iSeq의 read length는 150 bp이다. 또한 iSeq은 천만개(10^7)의 read를 읽는다. 따라서 최소 1.5 Gbp의 yeild가 생성된다. Coverage Depth of coverage : 특정 샘플을 시퀀싱 하였을 때 출력된 데이터에서 특정 염기에 대한 시퀀싱 결과의 중복된 횟수로, 10x, 20x 등으로 표현한..